根據教育部最新公布的《普通高等學校本科專業目錄》可知，生物工程類專業屬于工學門類，包括生物工程、生物制藥、合成生物學等3個專業，具體名單一覽表如下：

其中特設專業在專業代碼后加T表示，國家控制布點專業在專業代碼后加K表示。

生物工程專業簡介：

生物工程專業通過掌握生物技術及其產業化的科學原理、工藝技術過程和工程設計等基礎理論，基本技能，培養能在生物技術與工程領域從事設計生產管理和新技術研究、新產品開發的工程技術人才。

主干課程：高等數學、線性代數、無機化學與化學分析、植物組織培養技術、有機化學、生物化學、化工原理、生化工程、微生物學、細胞生物學、遺傳學、分子生物學、基因工程、細胞工程、蛋白質工程、微生物工程、生物工程下游技術、發酵工程設備、概率論與數理統計、動物生理學、生態學等。

生物制藥專業簡介：

培養具有良好的人文素養和扎實的自然科學基本理論知識，有較強的生物制藥理論基礎與實踐技能，了解學科和產業發展趨勢，能在生物醫藥、生物制品及相關領域從事研發、生產、質控等工作，并具有一定營銷、管理等知識的現代生命科學與生物醫藥產業亟需的高層次人才。

主要課程有：生物化學、基因工程、免疫學、藥理學、生物制藥工藝學、藥劑學、藥物分析等。

合成生物學專業簡介：

合成生物學，是一門普通高等學校本科專業，基本修業年限為4年，授予工學學士學位。

培養適應社會主義現代化建設需要、德智體美全面發展，具備良好職業道德，具備合成生物技術基本理論和專業知識，并能分析和解決重大環保、能源、生物醫藥、信息、輕工、食品、和軍工等應用領域的工程問題的能力，具有創新精神、和較好的國際交流能力的高級工程技術人才。

主要課程有：合成生物學、生物化學、有機合成化學、代謝工程、生物信息學、化學生物學、基因工程、生物制藥工程、環境生物技術，能源生物技術等，以及相關實驗。